神户大学与七所旧帝国大学、及前身同为商科学校的一桥大学、工科的东京工业大学合称"旧帝一工神“，代表着日本顶尖国立大学的最高学术水平。其中经济学稳居日本前三，法学和政治学亦具有顶尖实力，仅次于东京大学，拥有西日本地区规模最大的法学部，也是20世纪80年代之前仅有的九个法学部之一。此外，神户大学还设有全日本大学中唯一的海事学部。医学部和农学部实力强劲。

神户大学世界排名

2013年

QS世界大学排名 第304名

世界大学学术排名（ARWU） 第213名

2014年

QS世界大学排名 第294名

世界大学学术排名（ARWU） 第217名

2019年

U.S. News世界大学排名 日本第13位 世界第541位

世界大学学术排名 2019-2020 日本第11-14位 世界第401-500位

2020年

CWUR世界大学排名 日本第14位 世界第444位

QS世界大学排名 日本第14位 世界第403位

神户大学亚洲排名

2013年

QS亚洲大学排名 第41名

2014年

QS亚洲大学排名 第43名

神户大学国内排名

2020年

2020泰晤士高等教育日本大学排名第15位

2021U.S. News世界大学排名第11位。