日本医学专业排名靠前的大学有：

东京大学(University of Tokyo)

东京大学诞生于1877年，由“东京开成学校”与“东京医学校”在明治维新期间合并改制而成，初设法学、理学、文学、医学四个学部和一所大学预备学校，是日本第一所国立综合性大学，其部分科系最早可以溯源到灵元天皇时期；学校于1886年更名为“帝国大学”，这也是日本建立的第一所帝国大学；1897年，其易名为“东京帝国大学”；二战后的1947年9月，正式定名为“东京大学”。

京都大学(Kyoto University)

京都大学拥有京都大学iPS细胞研究所、京都大学数理解析研究所、京都大学防灾研究所等多个一流的科研机构。截至2020年，共有19位诺贝尔奖得主与京都大学存在某种程度的关联，其中校友和教授共11位。世界上第一位黄种人诺贝尔奖得主汤川秀树亦为该校教授。

大阪大学(Osaka University)

大阪大学起源于1838年绪方洪庵设立的兰学塾“适塾“。1931年，原大阪医科大学的医学部与理学部组成大阪帝国大学，成为日本第六所旧帝国大学，之后吸收了原大阪工业大学的工学部。二战后，正式更名为大阪大学，并陆续统合了大阪高等学校、浪速高等学校、大阪药学专门学校，形成一所规模较大的综合性大学。2007年，大阪外国语大学兼并为其外国语学部。

东北大学(Tohoku University)

作为日本旧帝国大学之一，东北大是日本文部科学省指定国立大学和超级国际化大学计划的A类顶尖校，八大学工学系联合会、学术研究恳谈会（RU11）、卓越研究生院计划、领先研究生院计划成员，国际高校联盟环太平洋大学联盟、东亚研究型大学协会重要成员，参与日英RENKEI等项目。该校现已涵盖文、理、工、医、农各科。

庆应义塾大学(Keio University)

庆应义塾大学（Keio University），亦称庆应大学，简称庆大（けいだい），是一所世界著名研究型综合大学，也是日本历史上第一所高等教育机构。庆应的前身是创立于1858年的“兰学塾”，是江户时代一所传播西洋自然科学的私塾学堂，在创始人福泽谕吉的指导和影响下不断发展，在日本社会中发挥着先驱领导作用。

东京医科齿科大学(Tokyo Medical and Dental University)

东京医科齿科大学（英文：Tokyo Medical and Dental University；日文平假名：とうきょういかしかだいがく），简称东京医齿大，位于日本东京都文京区，是日本著名的国立大学，指定国立大学成员。于1928年建立，1946年开设大学教育。其齿学部是日本最早成立的公立牙医学教育机构，也是旧六齿科大学之一，2004年4月成立国立大学法人。东京医科齿科大学拥有2个学部、2个研究科、2所图书馆、2所附属医院，以及众多的研究机构。

名古屋大学(Nagoya University)

名古屋大学创办于1871年。1939年被命名为名古屋帝国大学，成为日本最年轻的旧帝国大学。1947年正式更名为“名古屋大学”。2004年，国立大学法人名古屋大学成立。2020年，国立大学法人东海国立大学机构成立。名古屋大学现拥有10个学部、15个研究科、3个研究所、2所全国共同利用共同研究基地、29处校内共同教育研究设施。

九州大学(Kyushu University)

东京帝国大学和京都帝国大学建立后，日本国内就有再在九州建立一所帝国大学的提议。1903年4月，作为京都帝国大学的分部，九大前身的京都帝国大学附属福冈医科大学成立。1911年，其被日本政府单独设立为“九州帝国大学”。二战后的1947年，其被正式定名为“九州大学”。九大共拥有12个学部、18个研究科、5个研究所，在校学生约18619名、教员约2074名，其中外国教员271人，国际留学生共2387名。

北海道大学(Hokkaido Universit)

北海道大学创立于1876年，其前身为札幌农学校，是日本最早的高等教育机构。1918年，札幌农学校更名为北海道帝国大学。作为七所帝国大学之一，北海道帝国大学是日本设立的第四所帝国大学。1947年，北海道帝国大学更名为北海道大学。2004年，“国立大学法人北海道大学”创建 。2010年，北海道大学工学部教授铃木章荣获诺贝尔化学奖。2021年，北海道大学Benjamin List教授荣获诺贝尔化学奖。

冈山大学(Okayama University)

冈山大学在第二次世界大战前曾经被提议为日本帝国大学建设计划（即如今代表日本最高教育水平的“旧制帝国大学”）中的一员，但在随后的日本帝国议会中被否定，正因如此，冈山大学也被称作日本的准帝国大学，享有极高的教学声誉。

此外，被日本文部科学省“研究大学强化促进事业”和日本厚生劳动省“临床研究核心医院整备事业”两个项目同时选中的除了七所旧制帝国大学之外，只有冈山大学入选。