动画是更接近3D影视特效的技术，会培养学生从手工绘画、数码操作到音响控制等技能。而漫画方向是培养学生的艺术才能，一般学校会开设漫画基础、剧本、实践和漫画技术的课程，各个学校略有差异，但基本目标是把学生培养成有绘画能力和故事编写能力的漫画师。
去日本学漫画方向的学生要注意，到了硕士阶段，日本高校并不注重对学生基本漫画技能的培养，而是侧重对漫画理论的研究。
以下六所学校是有动漫专业的大学：
1、京都精华大学
简称精华大或精大。精华大是全日本第一所建立漫画专业的大学，是漫画专业领域中极具代表性的大学，拥有优秀的教授阵容，甚至在世界都倍受瞩目。2010年开始以研究漫画和发展漫画事业为目的创立了日本第一个漫画研究科。
在日本，京都精华大学的漫画研究科是培养漫画家和漫画研究者的摇篮。在那里学生可以学习到如何制作出所谓漫画家的漫画，还可以深入研究漫画诸多理论。
2、东京艺术大学
东京艺术大学，位于东京都台东区上野公园的日本国立大学。主要目的为培养美术和音乐领域的艺术家。也多被简称为“艺大”。东京艺大培养了日本代表性的艺术家，其中美术学部是日本绝大多数著名画家、艺术家的摇篮。
学校由美术学部(绘画科、雕刻科、工艺科、设计科、建筑科、先端艺术表现科、艺术学科)和音乐学部(作曲科、指挥科、声乐科、器乐科、邦乐科、乐理科、音乐环境创造科)等2学部14学科组成。
3、武藏野美术大学
武藏野美术大学建校于1962年，前身是始于1929年的帝国美术学校。武藏野美术大学是一所美术造型教育的综合性大学，美术学科设有日本画、油画、版画、雕刻4个专业;设计学科有视觉传达、工艺工业、空间演出、基础设计、建筑和映像6个专业。
为开拓新的领域，学校还新设了艺术文化和信息设计2个专业，共计12门专业。武藏野美术大学是日本学科领域分类最多并且教育规模较大的美术专门高等学府。
4、多摩美术大学
多摩美术大学，于1935年建立，1953年开设大学教育的日本私立大学。简称为“多摩美”。大学的主要校区分布在八王子和上野毛两地，现为日本规模最大的美术大学。也是东京五美大之一。同东京艺术大学、武藏野美术大学一道，为日本大家都向往的美术大学。
5、宝冢大学
宝塚大学是在1987年设立的私立大学，简称宝塚大。原名为宝塚造型艺术大学，由学校法人关西女子学院运营。由三大学科组成，分别为造型艺术，媒体内容设计，看护。
相对于设计、动漫专业，宝塚大学在造型艺术学科和媒体内容设计学科里都有相关课程的设立。但侧重点还是有些区别的，比如在造型艺术设计学科里的漫画课程，就会更偏重于电脑设计，抽象设计，就职方向是影视，舞台方面的动漫设计。而在媒体内容设计学科里的漫画课程，就偏重于独立的作品设计，手绘的基本技能，以漫画家，专职作者为目标培训人才。
6、东京工科大学
东京工科大学是地处东京的一家先进科学学科排位较高的高等院校。
作为一所知名的私立大学，东京工科大学的动漫专业开设时间较长，如今已经积累了丰富的经验，并且在一些国际动漫展上获得了不俗的成绩。师资力量方面，更是网集了一批在动漫领域著名的教授。
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